2个国家重点实验室:地质过程与矿产资源实验室、生物地质与环境地质实验室;
4个教育部重点实验室:岩石圈构造、深部过程及探测技术实验室,地下探测技术与仪器实验室、海相储层演化与油气富集机理实验室;地下水循环与环境演化实验室;
2个国土资源部重点实验室:土地整治实验室、地质超深钻探技术实验室;
2个北京市重点实验室:国土资源信息研究开发实验室、水资源与环境工程重点实验室;
4个国土资源部开放实验室:岩石圈构造与深部过程及探测技术开放实验室、非传统矿产资源研究开放实验室、地球物质科学研究开放实验室、矿产资源定量评价及信息系统开放实验室;
5个北京高等学校实验教学示范中心:物理实验教学中心、计算机实验教学中心、地质资源勘查实验教学中心和基础地学实验教学中心和珠宝与矿物材料实验教学中心;10个校级实验教学中心,15个教学实验室以及1个国家基础科学研究与教学人才培养基地。其中地学实验中心和建设工程质量检测中心已通过国家计量认证。